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アミノ酸
生体のタンパク質を構成するアミノ酸はα-アミノ酸(他にβ、γ)で標記には1文字表記と3文字表記の2種類ある。
参照
Wiki
二次構造
α-ヘリックス
β-シート
ランダム
構造チェック
RAPPER
http://mordred.bioc.cam.ac.uk/~rapper/
Skolnick lab
http://cssb.biology.gatech.edu/skolnick/
Sali lab
http://salilab.org/index.html
CHARMM
http://www.charmm.org
AMBER
http://ambermd.org/
TAP
http://protein.cribi.unipd.it/tap/
FRST
http://protein.cribi.unipd.it/frst/
ANOLEA
http://protein.bio.puc.cl/cardex/servers/anolea/
SIFT
http://sift.cchmc.org/
HARMONY
http://caps.ncbs.res.in/harmony/
酵素結合部位
VOIDOO
http://xray.bmc.uu.se/usf/voidoo.html
MolMovDB
http://www.molmovdb.org/
Evolutionary Trace
http://www-cryst.bioc.cam.ac.uk/~jiye/evoltrace/evoltrace.html
3D templates
CSA
http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/CSA/
Rigor
http://xray.bmc.uu.se/
Electrostatic potential
APBS
http://apbs.sourceforge.net/
DELPHI
http://wiki.c2b2.columbia.edu/honiglab_public/index.php/Software:DelPhi
Hydrogen bond
Grid
http://www.moldiscovery.com/soft_grid.php
MCSS
http://accelrys.com/
Biological Unit
PQS
http://www.ebi.ac.uk/msd-srv/pqs/
Pita
http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/pita/
PISA
http://www.ebi.ac.uk/msd-srv/prot_int/pistart.html
Last update 2018/09/04
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