CASP(Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction)  構造予測の世界コンテストで2年に1度開かれる。2006年にはCASP7 が開かれた。
報告書

ホモロジーモデリング
MODELLER
MOE
Discovery Studio
SWISS-MODEL Viewer
PDFAMS
FAMSBASE(Full Automatic Modeling System, 理化学研究所) since 2006/09/28
3D-JIGSAW
CPHModels
Composer

タンパク質スレッディング
3D-1D
PredictProtein
LIBRA I

統合
BioInfo Bank 九州工業大学 皿井研
denovo(ab initio)
Homology Modeling for Hyperchem

ドッキング
CMM(NIH)
ExPASy Proteomics Server
分子モデリング研究所
生活環境化学の部屋
eF-site(表面電荷の解析)
OSX Freeware

構造活性相関(QSAR)
MOE(菱化システム)
Catalyst(Accerlys)

その他 量子化学計算ソフト
Protein DF
NMR用
X-PLOR
講義・マニュアル
東京大学

08/09/18